Banca de QUALIFICAÇÃO: MARIA JULIA PEREIRA DAVI

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de MESTRADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : MARIA JULIA PEREIRA DAVI
DATA : 15/02/2022
HORA: 14:30
LOCAL: https://meet.google.com/art-msns-nss
TÍTULO:

Desenho e validação in silico de primers para reação em cadeia da polimerase para detecção de síndrome respiratória severa aguda do coronavírus 2 (SARS-CoV-2)

PALAVRAS-CHAVES:

Covid-19. Bioinformática. Diagnóstico. PCR.

PÁGINAS: 40
RESUMO:

O desenho de primers para reação em cadeia da polimerase (PCR) que tenham como alvo segmentos conservados de genomas virais é importante para prevenir resultados falso- negativos e diminuir a necessidade de padronização entre diferentes protocolos de PCR. Neste trabalho, foi projetado e descrito um conjunto de primers e sondas que têm como alvo regiões conservadas identificadas a partir de alinhamento múltiplo de 2.341 genomas de SARS-CoV-2 disponíveis no banco de dados GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Subsequentemente os primers foram validados juntamente com as sondas em 211.833 sequências de genomas completos de SARS-CoV-2. Foram obtidos nove sistemas (primer direto+reverso+sondas) que potencialmente anelam às regiões altamente conservadas do genoma do vírus desta análise. Predições in silico também demonstraram que os primers não interagem com alvos não-específicos em sequências de humanos, bactérias, fungos, Apicomplexa e outros betacoronavirus e linhagens menos patogênicas do coronavírus. A disponibilidade das sequências destes primers e sondas tornará possível validar protocolos mais eficientes para identificação do SARS-CoV-2.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Interno - 2170415 - Jorge Estefano de Santana Souza
Interno - 1507794 - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN