Banca de QUALIFICAÇÃO: DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : DIEGO ARTHUR DE AZEVEDO MORAIS
DATA : 01/07/2020
HORA: 14:00
LOCAL: Google Meet
TÍTULO:

PROTOCOLO MODULAR DE TRANSFERÊNCIA DE ANOTAÇÃO TAXONÔMICA E FUNCIONAL PARA METAGENOMAS

PALAVRAS-CHAVES:

Protocolo, análise funcional, análise taxonômica, metagenômica, transferência de anotação, classificação de sequência.

PÁGINAS: 66
RESUMO:

A metagenômica envolve o estudo da comunidade microbiana encontrada numa amostra extraída de um determinado ambiente. Este ambiente pode ser a parede de uma caverna, uma porção de água do oceano, o intestino humano, ou qualquer fonte contendo micro-organismos de interesse. A análise de uma comunidade microbiana revela detalhes sobre a composição taxonômica da amostra, e a função exercida pela comunidade. Algumas etapas são necessárias para realizar uma análise metagenômica completa, como o pré- processamento dos dados, o alinhamento contra um banco de dados de referência, a análise taxonômica, e a análise funcional. Apesar de existirem diversas ferramentas disponíveis para cada uma destas etapas, a escolha de um conjunto de ferramentas eficientes para realizar a análise continua sendo um desafio. O objetivo deste estudo é propor um protocolo modular a ser utilizado em análises taxonômicas e funcionais de metagenomas. Um script foi implementado em python para realizar a análise funcional, e as ferramentas de terceiros mais adequadas para cada etapa foram selecionadas. Dois conjuntos de dados foram simulados, para avaliar os resultados taxonômicos e funcionais separadamente, e ambas análises foram aplicadas a um metagenoma real. Os mesmos conjuntos de dados foram analisados utilizando o software MEGAN 6, e os resultados obtidos por ambas metodologias foram comparados. Métricas obtidas a partir dos resultados indicam que o protocolo proposto é mais adequado para análises funcionais utilizando identificadores do Gene Ontology, e identificou corretamente mais espécies e gêneros.

MEMBROS DA BANCA:
Interno - 2170415 - JORGE ESTEFANO SANTANA DE SOUZA
Interna - 1149647 - LUCYMARA FASSARELLA AGNEZ LIMA
Presidente - 1507794 - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN