Banca de QUALIFICAÇÃO: EDUARDO AUGUSTO DA SILVA DINIZ

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : EDUARDO AUGUSTO DA SILVA DINIZ
DATA : 27/04/2023
HORA: 09:00
LOCAL: videoconferência
TÍTULO:

AVALIAÇÃO COMPUTACIONAL DE INIBIDORES DE FOSFOLIPASE A₂ DE PEÇONHA DE Bothrops brazili

PALAVRAS-CHAVES:

Dinâmica molecular; Fosfolipase A2; Inibicão enzimática

PÁGINAS: 90
RESUMO:

A miotoxicidade causada por picada de serpentes surge como um dos principais problemas dos acidentes ofídicos, pois não é bem neutralizada pela soroterapia atual. Uma alternativa promissora é a busca por pequenas moléculas inibidoras que possam atuar eficientemente contra múltiplos componentes do veneno. A fosfolipase A₂ (PLA₂) é frequentemente encontrada no veneno de serpentes e geralmente está associada à miotoxicidade. Assim, representa um excelente alvo para a busca de novos tratamentos. Inicialmente foi estudado a interação da PLA₂ com modelos de membrana compostas por 1-palmitoil-2-oleoil fosfatidilglicerol (POPG) e 1-palmitoil-2-oleoil fosfatidilcolina (POPC) para identificar os resíduos da proteína mais importantes para interação com a membrana. Posteriormente, analisou-se o efeito da temperatura na inibição das propriedades catalíticas da PLA₂ do veneno de Bothrops brazili pelos ácidos rosmarínico (RSM) e clorogênico (CHL) através de abordagens experimentais e computacionais. Três temperaturas foram avaliadas (25, 37 e 50°C). Na seção experimental, ensaios enzimáticos mostraram que RSM é um melhor inibidor em todas as três temperaturas. A 50°C, a eficiência de inibição diminuiu significativamente para ambos os ácidos. Estudos de docking revelaram que ambos os ligantes se ligam ao canal hidrofóbico do dímero da proteína onde o fosfolipídio se liga no processo catalítico, interagindo com vários resíduos funcionais. Neste contexto, RSM apresenta melhores energias de interação devido a interações mais fortes com a cadeia B do dímero. Simulações de dinâmica molecular mostraram que RSM pode estabelecer interações seletivas com ARG112B de PLA₂, que está localizado próximo a resíduos do suposto sítio de ruptura de membrana em estruturas PLA₂-like. A afinidade dos ácidos RSM e CHL para PLA₂ é ditada principalmente por interações eletrostáticas, especialmente interações de pontes salinas estabelecidas com os resíduos ARG33B (para CHL) e ARG112B (RSM) e ligações de hidrogênio com o resíduo ASP89A. A incapacidade do CHL em estabelecer uma interação estável com o ARG112B foi apontada como o motivo de sua menor eficiência de inibição. A menor estabilidade conformacional da proteína promovida pelos ligantes a 37°C para CHL e a 50°C para RSM foi apontada como a razão da menor eficiência de inibição nessas respectivas temperaturas.

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1959889 - DAVI SERRADELLA VIEIRA
Externo ao Programa - 1893445 - EUZEBIO GUIMARAES BARBOSA - nullExterno ao Programa - 095.586.284-17 - SERGIO RUSCHI BERGAMACHI SILVA