Banca de QUALIFICAÇÃO: LUCAS RODOLFO INACIO DA SILVA

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : LUCAS RODOLFO INACIO DA SILVA
DATA : 30/01/2024
HORA: 14:00
LOCAL: Link do Google Meet: https://meet.google.com/hgu-vscf-nan
TÍTULO:

Investigação in sílico de peptídeos antivirais e proteína spike SARS-CoV-2 como alternativa terapêutica COVID-19

PALAVRAS-CHAVES:

Docking molecular, Doenças respiratórias, Estabilidade molecular, Proteínas virais.

PÁGINAS: 95
RESUMO:

A presente pesquisa se dedica à área promissora das terapias alternativas contra infecções causadas por vírus de RNA, com enfoque central na busca por peptídeos de afinidade capazes de interagir com as proteínas estruturais virais. O principal objetivo é investigar a aplicação desses peptídeos como potenciais agentes antivirais contra o SARS-CoV-2, por meio de uma abordagem molecular abrangente. A urgência em desenvolver estratégias terapêuticas inovadoras diante da COVID-19 e dos desafios apresentados pelos vírus de RNA, notadamente suas altas taxas de mutação, confirma a busca por terapias alternativas como uma prioridade incontestável. Os peptídeos de afinidade emergem como candidatos promissores nesse contexto, devido à sua capacidade singular de se ligar especificamente às proteínas estruturais virais, inibindo, assim, a entrada e replicação do vírus nas células hospedeiras. A pesquisa adotou uma abordagem multifásica, desdobrando-se em duas etapas cruciais: o docking molecular e a dinâmica molecular. O primeiro estágio compreendeu a seleção meticulosa de peptídeos antivirais candidatos, utilizando algoritmos de docking para prever suas interações com as proteínas estruturais dos vírus. Essa fase proporcionou uma visão preliminar das interações potenciais, identificando peptídeos que apresentaram alta afinidade por sítios específicos nas proteínas virais. Os peptídeos mais promissores, então, foram submetidos a simulações de dinâmica molecular, um método computacional sofisticado que avalia a estabilidade das interações. Esse procedimento permitiu uma análise minuciosa das trajetórias das interações peptídeo-proteína, fornecendo informações detalhadas sobre mudanças conformacionais, forças de ligação e estabilidade global. Os peptídeos Temporin L, SAP1, IBP02V1 e IPB02 foram submetidos a simulações de dinâmica molecular para avaliação. Os resultados revelaram uma elevada afinidade desses peptídeos pela proteína spike do SARS-CoV-2, destacando-se o IPB02 devido à sua ligação energeticamente favorável, evidenciada por uma energia de ligação negativa de -31.206 kCal/mol e sua estabilidade de longo prazo. Esses achados indicam o potencial eficaz dos peptídeos não apenas contra o SARS- CoV-2, mas também em relação a outros vírus de RNA, graças a atributos estruturais e funcionais compartilhados. O estudo sublinha a importância biotecnológica do emprego de bancos de dados de peptídeos e simulações computacionais para identificar candidatos antivirais promissores para doenças respiratórias, abrangendo infecções causadas pe

 

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Interno - 1056188 - THIAGO BRUCE RODRIGUES
Externo à Instituição - CARLOS HENRIQUE SALVINO GADELHA MENESES - UEPB