Banca de QUALIFICAÇÃO: JÚLIA FIRME FREITAS

Uma banca de QUALIFICAÇÃO de DOUTORADO foi cadastrada pelo programa.
DISCENTE : JÚLIA FIRME FREITAS
DATA : 01/09/2023
HORA: 14:30
LOCAL: Anfiteatro dos Répteis - Centro de Biociências/UFRN
TÍTULO:

Metagenoma e metatranscriptoma de patógenos presentes em  amostra de água residual da cidade de Natal - RN 

PALAVRAS-CHAVES:

Patógenos; DNA; RNA SARS-CoV-2; água residuais; WGS; Vigilância  genômica.

PÁGINAS: 77
RESUMO:

A pandemia da COVID-19 destacou a importância das tecnologias ômicas e da  epidemiologia baseada em esgoto. Adotar uma abordagem multidimensional é essencial para investigar ameaças emergentes a saúde. O principal objetivo deste estudo foi realizar  uma pesquisa abrangente e de longo prazo sobre a virosfera (vírus de DNA e RNA)  presentes em amostras de esgoto de Natal, Rio Grande do Norte, Brasil. Nosso propósito era compreender a estrutura completa, as relações e o potencial funcional da virosfera.  Utilizamos o sequenciamento metagenômico do DNA e RNA viral, extraídos da amostra  de esgoto coletadas semanalmente e fizemos um pool mensal, ao longo de um ano em  três estações de tratamento de esgoto (Baldo, Ponta Negra e Beira Rio). Avaliamos  virosfera completa e as classificações separadamente, vírus que infectam organismos  fotossintéticos, microrganismos e vertebrados e invertebrados. Nossos resultados de vírus  de DNA revelaram que a comunidade de vírus que infecta microrganismos nas amostras  é mais estável e abundantes, sendo dominada por Punalikevirus. A rede de interação desta  comunidade é forte interligada com vários vírus com altos valores de centralidade. A  comunidade de vírus que infectam organismos fotossintéticos foi dominada pelos gêneros  Orthotospovirus, Chlorovirus e o vírus não classificado da família Phycodnaviridae,  apresentando uma rede de interação era fracamente interligada. A comunidade de vírus  que infecta vertebrados e invertebrados. A comunidade de vírus que infecta vertebrados  e invertebrados foi dominada pelo gênero Bocaparvovirus, e a comunidade apresentou  uma rede de interação fortemente relacionada. Os vírus de RNA também apresentam uma  comunidade total bem estabelecida ao longo do ano, sendo dominada por vírus que  infectam fotossintéticos, os gêneros Sobemovirus e Tobamovirus, e uma rede de interação  fortemente relacionada. A comunidade que infecta microrganismos também apresenta  estabilidade, sendo dominada pelo gênero Alphaendornavirus, e uma rede fracamente  interligada. A comunidade de vírus que infectam vertebrados e invertebrados apresentou  dois perfis de dominação com os gêneros Mamastovirus e Husavirus e Noravirus, e uma  rede de interação fortemente interligada. Ao que concerne ao SARS-CoV-2 apesar da  baixa abundância ele foi interligado a diversos vírus, incluindo vírus não classificados.  Adicionalmente, nosso estudo empenhou-se em analisar a presença da família  Coronaviridae nos metagenomas, comparando-o com casos confirmados da doença e os padrões de chuva da cidade de Natal. Sugerimos uma associação entre a presença da  família nas amostras de esgoto coletadas e os padrões da chuva, bem como a incidência  de casos confirmados de COVID-19 na região. Para validade nossas descobertas,  utilizamos o RT-qPCR para confirmar os dados e garantir a precisão de nossos resultados. Nossos resultados demonstram a necessidade de uma investigação virologia abrangente  para compreender as contribuições de vírus não classificados dentro da virosfera. A  amostragem temporal revelou-se essencial em casos de desordem da comunidade, mas os  ambientes estáveis com interações relativamente constantes podem ser adequadamente representados por uma amostragem de ponto único. No entanto, diversidade e  complexidade da comunidade viral nas águas residuais exigem pesquisas contínuas para  entender melhor os vírus e seu papel na virosfera, dando suporte a preparação e respostas  a futuras ameaças virais.  

MEMBROS DA BANCA:
Presidente - 1880243 - DANIEL CARLOS FERREIRA LANZA
Externa ao Programa - 1801992 - PAULA RENATA LIMA MACHADO - UFRNExterno ao Programa - 1507794 - RODRIGO JULIANI SIQUEIRA DALMOLIN - UFRN